Ο Τομέας ΦΑΠΧ περιλαμβάνει τα παρακάτω 4 Εργαστήρια με τις αντίστοιχες δραστηριότητες και γνωστικά πεδία:
1) Εργαστήριο Φυσικής Χημείας
Τα γνωστικά αντικείμενά του είναι η Φυσική Χημεία και Ηλεκτροχημεία και οι δραστηριότητες του περιλαμβάνουν, εκτός από διδασκαλία και εκπαίδευση φοιτητών, έρευνα σε ηλεκτροχημεία (ηλεκτροκατάλυση, ηλεκτροαπόθεση και διάβρωση-παθητικοποίηση μετάλλων, ηλεκτροχημικούς ταλαντωτές, κυψέλες καυσίμου), φωτοηλεκτροχημεία και ετερογενή φωτοκατάλυση, διεπιφάνειες και φαινόμενα προσρόφησης, αέρια χρωματογραφία αναστρεφόμενης ροής, ετερογενή κατάλυση και μοντελοποίηση χρωματογραφικών διεργασιών.
2) Εργαστήριο Αναλυτικής Χημείας
Το γνωστικό αντικείμενό του είναι η Αναλυτική Χημεία και οι δραστηριότητές του περιλαμβάνουν διδασκαλία και εκπαίδευση προπτυχιακών και μεταπτυχιακών φοιτητών, και πρωτότυπη έρευνα στην ανάπτυξη, βελτιστοποίηση, επικύρωση και εφαρμογή νέων αναλυτικών μεθόδων καθώς και διερεύνηση νέων ενόργανων αναλυτικών τεχνικών και καινοτόμων υλικών που χρησιμοποιούνται στην ανάλυση.
3) Εργαστήριο Ελέγχου Ρύπανσης Περιβάλλοντος
To γνωστικό αντικείμενο είναι Χημεία και ο Έλεγχος Ρύπανσης Περιβάλλοντος. Στο εργαστήριο αναπτύσσεται ερευνητική και εκπαιδευτική δραστηριότητα σε θέματα χημείας περιβάλλοντος, ελέγχου και προστασίας του ατμοσφαιρικού, υδάτινου και χερσαίου περιβάλλοντος.
4) Εργαστήριο Χημικής Εκπαίδευσης, Εφαρμογής Τεχνολογιών Πληροφορικής και Επικοινωνιών στη Χημεία
To γνωστικό αντικείμενο είναι Χημική Εκπαίδευση και οι Τεχνολογίες Πληροφορικής και Επικοινωνιών στη Χημεία. Στο εργαστήριο αναπτύσσεται ερευνητική και εκπαιδευτική δραστηριότητα σε θέματα μελέτης και βελτίωσης τρόπων και μεθόδων της διδασκαλίας της Χημείας (στο πλαίσιο της Διδασκαλίας των Φυσικών Επιστημών) και μελέτη της αλληλεπίδρασης της Χημείας με γνωστικά αντικείμενα άλλων επιστημών.